Akdeniz Eğitim Araştırmaları Dergisi (MJER) hakemli bir dergidir. Gönderilen makaleler en az iki hakem (kör hakem) tarafından değerlendirilir. Hakem değerlendirme süreci dergi yoğunluğuna göre değişmekle birlikte, 1-3 ay içerisinde tamamlanır.

Makaleler öncelikle Editör tarafından ön incelemeye alınır. Şekilsel ve içerik olarak uygun bulunan makaleler en az iki hakeme gönderilerek değerlendirmeye alınır. Kör hakemlik uygulaması gereği hakemler birbirini veya makale yazar veya yazarlarının kimliğini bilmedikleri gibi yazarlarda hakemlerin kimliklerini bilmemektedirler. Değerlendirme sürecinin ardından editör hakem raporlarının ışığında  makalenin kabul veya red durumuna karar verir. Köklü değişiklik talep edilen makaleler için süreç en başa alınarak yenilenir. Kabul edilen makaleler uygun bulunan sayıda yayınlanmak üzere sıraya alınır.